Se encuentra en el interior del Conjunto Misional Jesuitico y su principal funcionalidad es conservar y mostrar elementos que datan de la época de la construcción de la Capilla Mortuoria, Templo, Campanario y Bóveda.

Ocupa la antigua Casa de los Misioneros o Colegio, en sus paredes se pueden apreciar mas de 2.500 m2 de pinturas en murales recuperadas y restauradas, que datan de finales del siglo XVII y principios del siglo XIX.

Entre los murales que destacan podemos mencionar un desfile militar con estilo napoleónico o afrancesado, como también la recreación del Rey Fernando VII de Borbón, además de un plano urbano de San José de Chiquitos de la época de la Reducción Misional.

También se exponen objetos recuperados y conservados como tallados de imagenería sacra y platería.